Các loài còn sinh tồn được sắp xếp theo trật tự phát sinh chủng loài.

• Pelecanus erythrorhynchos - Bồ nông trắng Mỹ
• Pelecanus occidentalis - Bồ nông nâu
• Pelecanus thagus - Bồ nông Peru
• Pelecanus onocrotalus - Bồ nông chân hồng
• Pelecanus conspicillatus - Bồ nông Úc
• Pelecanus rufescens - Bồ nông lưng hồng
• Pelecanus crispus - Bồ nông Dalmatia
• Pelecanus philippensis - Bồ nông chân xám

Nhiều loài Pelecanus tuyệt chủng được biết đến nhờ hóa thạch, gồm:[1]

• Pelecanus cadimurka, Rich & van Tets, 1981 (Late Pliocene, South Australia)[2]
• Pelecanus cautleyi, Davies, 1880 (Pliocen sớm, Siwalik Hills, Ấn Độ)[1]
• Pelecanus fraasi, Lydekker, 1891 (Miocen giữa, Bavaria, Đức)[1]
• Pelecanus gracilis, Milne-Edwards, 1863 (Miocen sớm, Pháp) (see: Miopelecanus)[1]
• Pelecanus halieus, Wetmore, 1933 (Pliocen muộn, Idaho, Mỹ)[3]
• Pelecanus intermedius, Fraas, 1870 (Miocen giữa, Bavaria, Đức)[1] (chuyển sang Miopelecanus bởi Cheneval năm 1984)
• Pelecanus odessanus, Widhalm, 1886 (Miocen muộn, gần Odessa, Ukraine)[4]
• Pelecanus schreiberi, Olson, 1999 (Pliocen sớm, Bắc Carolina, Mỹ)[5]
• Pelecanus sivalensis, Davies, 1880 (Pliocen sớm, Siwalik Hills, Ấn Độ)[1]
• Pelecanus tirarensis, Miller, 1966 (Oligocen muộn tới Miocen giữa, Nam Úc)[6]